Protein–RNA interactions for Protein: O35602

Rax, Retinal homeobox protein Rx, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RaxO35602 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RaxO35602 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RaxO35602 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RaxO35602 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RaxO35602 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RaxO35602 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RaxO35602 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RaxO35602 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RaxO35602 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RaxO35602 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RaxO35602 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RaxO35602 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RaxO35602 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RaxO35602 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RaxO35602 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RaxO35602 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RaxO35602 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RaxO35602 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RaxO35602 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RaxO35602 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RaxO35602 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RaxO35602 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RaxO35602 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RaxO35602 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RaxO35602 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RaxO35602 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RaxO35602 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
RaxO35602 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RaxO35602 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
RaxO35602 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RaxO35602 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RaxO35602 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RaxO35602 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RaxO35602 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RaxO35602 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RaxO35602 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
RaxO35602 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RaxO35602 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RaxO35602 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RaxO35602 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RaxO35602 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RaxO35602 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RaxO35602 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RaxO35602 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RaxO35602 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RaxO35602 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RaxO35602 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RaxO35602 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RaxO35602 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RaxO35602 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RaxO35602 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RaxO35602 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RaxO35602 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
RaxO35602 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RaxO35602 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
RaxO35602 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RaxO35602 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
RaxO35602 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RaxO35602 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
RaxO35602 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RaxO35602 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RaxO35602 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RaxO35602 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RaxO35602 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RaxO35602 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
RaxO35602 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RaxO35602 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RaxO35602 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RaxO35602 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RaxO35602 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RaxO35602 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RaxO35602 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RaxO35602 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RaxO35602 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RaxO35602 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RaxO35602 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RaxO35602 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RaxO35602 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RaxO35602 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RaxO35602 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RaxO35602 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RaxO35602 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RaxO35602 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RaxO35602 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RaxO35602 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RaxO35602 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RaxO35602 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RaxO35602 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RaxO35602 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RaxO35602 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RaxO35602 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RaxO35602 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RaxO35602 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RaxO35602 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RaxO35602 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RaxO35602 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RaxO35602 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RaxO35602 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RaxO35602 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RaxO35602 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms