Protein–RNA interactions for Protein: O35457

Ccrl2, C-C chemokine receptor-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccrl2O35457 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccrl2O35457 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccrl2O35457 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccrl2O35457 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccrl2O35457 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccrl2O35457 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccrl2O35457 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccrl2O35457 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccrl2O35457 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccrl2O35457 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccrl2O35457 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccrl2O35457 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccrl2O35457 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccrl2O35457 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccrl2O35457 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccrl2O35457 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccrl2O35457 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccrl2O35457 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ccrl2O35457 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccrl2O35457 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccrl2O35457 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccrl2O35457 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccrl2O35457 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccrl2O35457 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccrl2O35457 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccrl2O35457 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccrl2O35457 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccrl2O35457 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccrl2O35457 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccrl2O35457 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccrl2O35457 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccrl2O35457 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccrl2O35457 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccrl2O35457 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccrl2O35457 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccrl2O35457 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccrl2O35457 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccrl2O35457 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccrl2O35457 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccrl2O35457 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccrl2O35457 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccrl2O35457 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ccrl2O35457 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccrl2O35457 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccrl2O35457 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccrl2O35457 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccrl2O35457 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccrl2O35457 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccrl2O35457 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccrl2O35457 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccrl2O35457 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccrl2O35457 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccrl2O35457 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccrl2O35457 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccrl2O35457 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccrl2O35457 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ccrl2O35457 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccrl2O35457 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccrl2O35457 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccrl2O35457 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccrl2O35457 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccrl2O35457 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccrl2O35457 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccrl2O35457 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccrl2O35457 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccrl2O35457 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccrl2O35457 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccrl2O35457 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccrl2O35457 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms