Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Atf6bO35451 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Atf6bO35451 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf6bO35451 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf6bO35451 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf6bO35451 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf6bO35451 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf6bO35451 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf6bO35451 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf6bO35451 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf6bO35451 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf6bO35451 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf6bO35451 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf6bO35451 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf6bO35451 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf6bO35451 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Atf6bO35451 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf6bO35451 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf6bO35451 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf6bO35451 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf6bO35451 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf6bO35451 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf6bO35451 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf6bO35451 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Atf6bO35451 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf6bO35451 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Atf6bO35451 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Atf6bO35451 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Atf6bO35451 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf6bO35451 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf6bO35451 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Atf6bO35451 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Atf6bO35451 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf6bO35451 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf6bO35451 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf6bO35451 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf6bO35451 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf6bO35451 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf6bO35451 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf6bO35451 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf6bO35451 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf6bO35451 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf6bO35451 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf6bO35451 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf6bO35451 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf6bO35451 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Atf6bO35451 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf6bO35451 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf6bO35451 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf6bO35451 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf6bO35451 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf6bO35451 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf6bO35451 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Atf6bO35451 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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