Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prrt1O35449 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms