Protein–RNA interactions for Protein: O35216

Cenpa, Histone H3-like centromeric protein A, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpaO35216 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CenpaO35216 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CenpaO35216 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CenpaO35216 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CenpaO35216 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CenpaO35216 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CenpaO35216 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CenpaO35216 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CenpaO35216 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CenpaO35216 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CenpaO35216 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CenpaO35216 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CenpaO35216 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CenpaO35216 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CenpaO35216 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CenpaO35216 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CenpaO35216 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CenpaO35216 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CenpaO35216 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CenpaO35216 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CenpaO35216 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CenpaO35216 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CenpaO35216 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CenpaO35216 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CenpaO35216 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CenpaO35216 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CenpaO35216 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CenpaO35216 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CenpaO35216 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CenpaO35216 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CenpaO35216 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CenpaO35216 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CenpaO35216 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CenpaO35216 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CenpaO35216 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CenpaO35216 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CenpaO35216 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CenpaO35216 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CenpaO35216 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CenpaO35216 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CenpaO35216 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CenpaO35216 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CenpaO35216 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CenpaO35216 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CenpaO35216 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CenpaO35216 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CenpaO35216 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CenpaO35216 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CenpaO35216 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CenpaO35216 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CenpaO35216 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CenpaO35216 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CenpaO35216 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CenpaO35216 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CenpaO35216 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CenpaO35216 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CenpaO35216 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CenpaO35216 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CenpaO35216 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CenpaO35216 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CenpaO35216 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CenpaO35216 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CenpaO35216 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CenpaO35216 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CenpaO35216 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CenpaO35216 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CenpaO35216 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CenpaO35216 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CenpaO35216 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CenpaO35216 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CenpaO35216 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CenpaO35216 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CenpaO35216 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CenpaO35216 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CenpaO35216 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CenpaO35216 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CenpaO35216 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CenpaO35216 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CenpaO35216 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CenpaO35216 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CenpaO35216 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CenpaO35216 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CenpaO35216 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CenpaO35216 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CenpaO35216 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CenpaO35216 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CenpaO35216 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CenpaO35216 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CenpaO35216 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CenpaO35216 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CenpaO35216 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CenpaO35216 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CenpaO35216 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CenpaO35216 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CenpaO35216 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CenpaO35216 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CenpaO35216 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CenpaO35216 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CenpaO35216 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CenpaO35216 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms