Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smad6O35182 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smad6O35182 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smad6O35182 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smad6O35182 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smad6O35182 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smad6O35182 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Smad6O35182 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smad6O35182 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smad6O35182 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smad6O35182 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smad6O35182 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smad6O35182 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smad6O35182 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smad6O35182 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smad6O35182 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Smad6O35182 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smad6O35182 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smad6O35182 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Smad6O35182 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Smad6O35182 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smad6O35182 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smad6O35182 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smad6O35182 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smad6O35182 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smad6O35182 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smad6O35182 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smad6O35182 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smad6O35182 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smad6O35182 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smad6O35182 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smad6O35182 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Smad6O35182 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smad6O35182 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smad6O35182 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smad6O35182 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smad6O35182 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smad6O35182 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Smad6O35182 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smad6O35182 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Smad6O35182 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Smad6O35182 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smad6O35182 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smad6O35182 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smad6O35182 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms