Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Pitx3O35160 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitx3O35160 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pitx3O35160 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitx3O35160 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitx3O35160 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitx3O35160 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitx3O35160 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitx3O35160 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitx3O35160 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitx3O35160 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitx3O35160 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitx3O35160 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Pitx3O35160 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Pitx3O35160 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitx3O35160 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Pitx3O35160 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Pitx3O35160 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pitx3O35160 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pitx3O35160 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pitx3O35160 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Pitx3O35160 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Pitx3O35160 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pitx3O35160 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pitx3O35160 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Pitx3O35160 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pitx3O35160 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Pitx3O35160 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pitx3O35160 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pitx3O35160 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pitx3O35160 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pitx3O35160 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pitx3O35160 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pitx3O35160 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pitx3O35160 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pitx3O35160 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pitx3O35160 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pitx3O35160 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pitx3O35160 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pitx3O35160 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pitx3O35160 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pitx3O35160 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Pitx3O35160 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Pitx3O35160 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pitx3O35160 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pitx3O35160 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pitx3O35160 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pitx3O35160 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pitx3O35160 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pitx3O35160 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pitx3O35160 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pitx3O35160 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Pitx3O35160 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Pitx3O35160 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pitx3O35160 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pitx3O35160 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pitx3O35160 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Pitx3O35160 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pitx3O35160 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Pitx3O35160 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Pitx3O35160 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pitx3O35160 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pitx3O35160 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pitx3O35160 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pitx3O35160 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pitx3O35160 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pitx3O35160 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pitx3O35160 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pitx3O35160 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pitx3O35160 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pitx3O35160 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pitx3O35160 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Pitx3O35160 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pitx3O35160 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Pitx3O35160 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pitx3O35160 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pitx3O35160 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pitx3O35160 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.03■□□□□ -0
Pitx3O35160 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Pitx3O35160 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Pitx3O35160 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pitx3O35160 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pitx3O35160 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Pitx3O35160 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pitx3O35160 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pitx3O35160 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Pitx3O35160 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pitx3O35160 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pitx3O35160 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Pitx3O35160 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pitx3O35160 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Pitx3O35160 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pitx3O35160 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Pitx3O35160 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Pitx3O35160 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Pitx3O35160 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Pitx3O35160 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms