Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ArxO35085 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ArxO35085 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ArxO35085 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ArxO35085 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ArxO35085 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ArxO35085 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ArxO35085 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ArxO35085 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ArxO35085 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ArxO35085 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ArxO35085 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ArxO35085 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ArxO35085 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ArxO35085 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ArxO35085 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ArxO35085 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ArxO35085 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ArxO35085 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ArxO35085 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ArxO35085 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ArxO35085 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ArxO35085 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ArxO35085 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ArxO35085 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
ArxO35085 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ArxO35085 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ArxO35085 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ArxO35085 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ArxO35085 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ArxO35085 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ArxO35085 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ArxO35085 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ArxO35085 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ArxO35085 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ArxO35085 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ArxO35085 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ArxO35085 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ArxO35085 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ArxO35085 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ArxO35085 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ArxO35085 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ArxO35085 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ArxO35085 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ArxO35085 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ArxO35085 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ArxO35085 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ArxO35085 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ArxO35085 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ArxO35085 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ArxO35085 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ArxO35085 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ArxO35085 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ArxO35085 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ArxO35085 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
ArxO35085 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ArxO35085 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ArxO35085 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ArxO35085 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ArxO35085 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ArxO35085 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ArxO35085 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ArxO35085 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ArxO35085 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ArxO35085 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ArxO35085 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ArxO35085 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ArxO35085 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ArxO35085 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ArxO35085 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ArxO35085 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ArxO35085 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ArxO35085 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ArxO35085 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ArxO35085 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ArxO35085 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ArxO35085 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ArxO35085 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ArxO35085 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ArxO35085 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ArxO35085 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ArxO35085 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ArxO35085 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ArxO35085 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ArxO35085 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ArxO35085 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ArxO35085 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ArxO35085 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ArxO35085 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ArxO35085 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ArxO35085 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ArxO35085 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ArxO35085 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ArxO35085 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ArxO35085 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ArxO35085 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ArxO35085 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ArxO35085 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ArxO35085 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ArxO35085 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms