Protein–RNA interactions for Protein: O08788

Dctn1, Dynactin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn1O08788 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dctn1O08788 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dctn1O08788 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dctn1O08788 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dctn1O08788 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dctn1O08788 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dctn1O08788 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Dctn1O08788 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dctn1O08788 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Dctn1O08788 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dctn1O08788 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dctn1O08788 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dctn1O08788 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dctn1O08788 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dctn1O08788 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dctn1O08788 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dctn1O08788 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dctn1O08788 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dctn1O08788 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dctn1O08788 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dctn1O08788 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dctn1O08788 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dctn1O08788 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dctn1O08788 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dctn1O08788 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dctn1O08788 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dctn1O08788 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Dctn1O08788 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dctn1O08788 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dctn1O08788 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dctn1O08788 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dctn1O08788 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dctn1O08788 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dctn1O08788 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dctn1O08788 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dctn1O08788 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dctn1O08788 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dctn1O08788 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dctn1O08788 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dctn1O08788 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Dctn1O08788 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dctn1O08788 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dctn1O08788 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dctn1O08788 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dctn1O08788 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dctn1O08788 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dctn1O08788 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dctn1O08788 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dctn1O08788 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dctn1O08788 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dctn1O08788 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dctn1O08788 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dctn1O08788 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dctn1O08788 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dctn1O08788 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dctn1O08788 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dctn1O08788 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dctn1O08788 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dctn1O08788 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dctn1O08788 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dctn1O08788 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Dctn1O08788 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dctn1O08788 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dctn1O08788 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dctn1O08788 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dctn1O08788 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dctn1O08788 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dctn1O08788 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dctn1O08788 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dctn1O08788 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dctn1O08788 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dctn1O08788 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Dctn1O08788 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dctn1O08788 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Dctn1O08788 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dctn1O08788 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dctn1O08788 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dctn1O08788 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dctn1O08788 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dctn1O08788 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dctn1O08788 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dctn1O08788 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dctn1O08788 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dctn1O08788 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dctn1O08788 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Dctn1O08788 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dctn1O08788 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dctn1O08788 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dctn1O08788 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dctn1O08788 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dctn1O08788 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dctn1O08788 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dctn1O08788 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dctn1O08788 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dctn1O08788 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dctn1O08788 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dctn1O08788 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dctn1O08788 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dctn1O08788 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dctn1O08788 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms