Protein–RNA interactions for Protein: O08784

Tcof1, Treacle protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcof1O08784 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Tcof1O08784 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tcof1O08784 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Tcof1O08784 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcof1O08784 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcof1O08784 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcof1O08784 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcof1O08784 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcof1O08784 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcof1O08784 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Tcof1O08784 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcof1O08784 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcof1O08784 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcof1O08784 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcof1O08784 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcof1O08784 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcof1O08784 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcof1O08784 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcof1O08784 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcof1O08784 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcof1O08784 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcof1O08784 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcof1O08784 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcof1O08784 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Tcof1O08784 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tcof1O08784 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tcof1O08784 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Tcof1O08784 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Tcof1O08784 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tcof1O08784 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tcof1O08784 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tcof1O08784 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tcof1O08784 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tcof1O08784 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tcof1O08784 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tcof1O08784 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tcof1O08784 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tcof1O08784 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tcof1O08784 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tcof1O08784 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tcof1O08784 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tcof1O08784 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tcof1O08784 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Tcof1O08784 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tcof1O08784 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Tcof1O08784 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcof1O08784 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcof1O08784 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcof1O08784 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcof1O08784 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcof1O08784 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcof1O08784 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcof1O08784 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcof1O08784 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcof1O08784 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcof1O08784 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcof1O08784 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcof1O08784 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcof1O08784 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Tcof1O08784 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tcof1O08784 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tcof1O08784 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tcof1O08784 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tcof1O08784 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tcof1O08784 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tcof1O08784 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tcof1O08784 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Tcof1O08784 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tcof1O08784 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tcof1O08784 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tcof1O08784 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tcof1O08784 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tcof1O08784 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tcof1O08784 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tcof1O08784 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Tcof1O08784 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tcof1O08784 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tcof1O08784 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tcof1O08784 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.52■■□□□ 1.03
Tcof1O08784 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tcof1O08784 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Tcof1O08784 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcof1O08784 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcof1O08784 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcof1O08784 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcof1O08784 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcof1O08784 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcof1O08784 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcof1O08784 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcof1O08784 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcof1O08784 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Tcof1O08784 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcof1O08784 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcof1O08784 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcof1O08784 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcof1O08784 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcof1O08784 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcof1O08784 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcof1O08784 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Tcof1O08784 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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