Protein–RNA interactions for Protein: L7N232

Zfp955b, Zinc finger protein 955B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp955bL7N232 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Zfp955bL7N232 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zfp955bL7N232 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms