Protein–RNA interactions for Protein: L7N229

Gm4778, Predicted gene 4778, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm4778L7N229 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Gm4778L7N229 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm4778L7N229 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm4778L7N229 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm4778L7N229 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm4778L7N229 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm4778L7N229 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm4778L7N229 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm4778L7N229 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm4778L7N229 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm4778L7N229 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm4778L7N229 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm4778L7N229 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm4778L7N229 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm4778L7N229 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm4778L7N229 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm4778L7N229 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Gm4778L7N229 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Gm4778L7N229 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm4778L7N229 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Gm4778L7N229 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Gm4778L7N229 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm4778L7N229 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm4778L7N229 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4778L7N229 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4778L7N229 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4778L7N229 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Gm4778L7N229 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4778L7N229 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm4778L7N229 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Gm4778L7N229 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Gm4778L7N229 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm4778L7N229 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm4778L7N229 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gm4778L7N229 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Gm4778L7N229 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Gm4778L7N229 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Gm4778L7N229 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm4778L7N229 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm4778L7N229 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm4778L7N229 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Gm4778L7N229 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm4778L7N229 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm4778L7N229 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm4778L7N229 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm4778L7N229 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm4778L7N229 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm4778L7N229 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm4778L7N229 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm4778L7N229 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm4778L7N229 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm4778L7N229 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm4778L7N229 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm4778L7N229 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm4778L7N229 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm4778L7N229 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm4778L7N229 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm4778L7N229 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm4778L7N229 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm4778L7N229 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm4778L7N229 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm4778L7N229 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm4778L7N229 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm4778L7N229 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm4778L7N229 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
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