Protein–RNA interactions for Protein: J3QPA5

Gm3099, Predicted gene 3099, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3099J3QPA5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3099J3QPA5 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3099J3QPA5 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3099J3QPA5 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3099J3QPA5 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3099J3QPA5 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3099J3QPA5 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3099J3QPA5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3099J3QPA5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3099J3QPA5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3099J3QPA5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3099J3QPA5 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3099J3QPA5 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3099J3QPA5 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3099J3QPA5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3099J3QPA5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3099J3QPA5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3099J3QPA5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3099J3QPA5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3099J3QPA5 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3099J3QPA5 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3099J3QPA5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3099J3QPA5 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3099J3QPA5 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3099J3QPA5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3099J3QPA5 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3099J3QPA5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3099J3QPA5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3099J3QPA5 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3099J3QPA5 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3099J3QPA5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3099J3QPA5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3099J3QPA5 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3099J3QPA5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3099J3QPA5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3099J3QPA5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3099J3QPA5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3099J3QPA5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3099J3QPA5 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3099J3QPA5 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3099J3QPA5 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm3099J3QPA5 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3099J3QPA5 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3099J3QPA5 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3099J3QPA5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms