Protein–RNA interactions for Protein: J3QMQ6

Gm3336, Predicted gene 3336, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3336J3QMQ6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3336J3QMQ6 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3336J3QMQ6 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3336J3QMQ6 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3336J3QMQ6 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3336J3QMQ6 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3336J3QMQ6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3336J3QMQ6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3336J3QMQ6 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3336J3QMQ6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3336J3QMQ6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3336J3QMQ6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3336J3QMQ6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3336J3QMQ6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3336J3QMQ6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3336J3QMQ6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3336J3QMQ6 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm3336J3QMQ6 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3336J3QMQ6 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3336J3QMQ6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3336J3QMQ6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3336J3QMQ6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3336J3QMQ6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3336J3QMQ6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3336J3QMQ6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3336J3QMQ6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3336J3QMQ6 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3336J3QMQ6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3336J3QMQ6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3336J3QMQ6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3336J3QMQ6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3336J3QMQ6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3336J3QMQ6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3336J3QMQ6 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3336J3QMQ6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3336J3QMQ6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3336J3QMQ6 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3336J3QMQ6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3336J3QMQ6 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3336J3QMQ6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3336J3QMQ6 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm3336J3QMQ6 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3336J3QMQ6 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3336J3QMQ6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3336J3QMQ6 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3336J3QMQ6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3336J3QMQ6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3336J3QMQ6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3336J3QMQ6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3336J3QMQ6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3336J3QMQ6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3336J3QMQ6 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3336J3QMQ6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm3336J3QMQ6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm3336J3QMQ6 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm3336J3QMQ6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm3336J3QMQ6 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm3336J3QMQ6 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm3336J3QMQ6 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm3336J3QMQ6 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm3336J3QMQ6 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm3336J3QMQ6 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm3336J3QMQ6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm3336J3QMQ6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm3336J3QMQ6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm3336J3QMQ6 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm3336J3QMQ6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm3336J3QMQ6 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm3336J3QMQ6 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm3336J3QMQ6 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm3336J3QMQ6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm3336J3QMQ6 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm3336J3QMQ6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm3336J3QMQ6 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm3336J3QMQ6 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm3336J3QMQ6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm3336J3QMQ6 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm3336J3QMQ6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm3336J3QMQ6 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm3336J3QMQ6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm3336J3QMQ6 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm3336J3QMQ6 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm3336J3QMQ6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm3336J3QMQ6 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm3336J3QMQ6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm3336J3QMQ6 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm3336J3QMQ6 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm3336J3QMQ6 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm3336J3QMQ6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm3336J3QMQ6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm3336J3QMQ6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm3336J3QMQ6 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm3336J3QMQ6 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm3336J3QMQ6 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm3336J3QMQ6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm3336J3QMQ6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm3336J3QMQ6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm3336J3QMQ6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gm3336J3QMQ6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gm3336J3QMQ6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms