Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
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Gm21818J3KMS6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
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Gm21818J3KMS6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Gm21818J3KMS6 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Gm21818J3KMS6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Gm21818J3KMS6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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Gm21818J3KMS6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
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Gm21818J3KMS6 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gm21818J3KMS6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
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