Protein–RNA interactions for Protein: H3BIW7

Gm29394, Predicted gene 29394, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29394H3BIW7 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm29394H3BIW7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm29394H3BIW7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms