Protein–RNA interactions for Protein: G3X9F6

Sh3tc1, SH3 domain and tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3tc1G3X9F6 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Sh3tc1G3X9F6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3tc1G3X9F6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3tc1G3X9F6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3tc1G3X9F6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3tc1G3X9F6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3tc1G3X9F6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3tc1G3X9F6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3tc1G3X9F6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3tc1G3X9F6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3tc1G3X9F6 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3tc1G3X9F6 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3tc1G3X9F6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3tc1G3X9F6 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3tc1G3X9F6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Sh3tc1G3X9F6 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3tc1G3X9F6 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3tc1G3X9F6 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3tc1G3X9F6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3tc1G3X9F6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3tc1G3X9F6 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3tc1G3X9F6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3tc1G3X9F6 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Sh3tc1G3X9F6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh3tc1G3X9F6 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh3tc1G3X9F6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh3tc1G3X9F6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh3tc1G3X9F6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh3tc1G3X9F6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sh3tc1G3X9F6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Sh3tc1G3X9F6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms