Protein–RNA interactions for Protein: G3UVU6

Gm20517, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 20, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20517G3UVU6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Gm20517G3UVU6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Gm20517G3UVU6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms