Protein–RNA interactions for Protein: F8VQC1

Srp72, Signal recognition particle subunit SRP72, mousemouse

Predictions only

Length 671 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp72F8VQC1 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Srp72F8VQC1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms