Protein–RNA interactions for Protein: F8VQB8

Npcd, Neuronal pentraxin chromo domain, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NpcdF8VQB8 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NpcdF8VQB8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NpcdF8VQB8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NpcdF8VQB8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NpcdF8VQB8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NpcdF8VQB8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NpcdF8VQB8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NpcdF8VQB8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NpcdF8VQB8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NpcdF8VQB8 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NpcdF8VQB8 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NpcdF8VQB8 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NpcdF8VQB8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NpcdF8VQB8 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NpcdF8VQB8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NpcdF8VQB8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NpcdF8VQB8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NpcdF8VQB8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NpcdF8VQB8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NpcdF8VQB8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NpcdF8VQB8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NpcdF8VQB8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NpcdF8VQB8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NpcdF8VQB8 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NpcdF8VQB8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NpcdF8VQB8 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NpcdF8VQB8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NpcdF8VQB8 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NpcdF8VQB8 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NpcdF8VQB8 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NpcdF8VQB8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NpcdF8VQB8 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NpcdF8VQB8 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NpcdF8VQB8 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NpcdF8VQB8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NpcdF8VQB8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NpcdF8VQB8 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NpcdF8VQB8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NpcdF8VQB8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NpcdF8VQB8 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NpcdF8VQB8 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NpcdF8VQB8 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NpcdF8VQB8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NpcdF8VQB8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NpcdF8VQB8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NpcdF8VQB8 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NpcdF8VQB8 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NpcdF8VQB8 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NpcdF8VQB8 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NpcdF8VQB8 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NpcdF8VQB8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NpcdF8VQB8 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NpcdF8VQB8 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NpcdF8VQB8 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NpcdF8VQB8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NpcdF8VQB8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NpcdF8VQB8 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NpcdF8VQB8 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NpcdF8VQB8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NpcdF8VQB8 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NpcdF8VQB8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NpcdF8VQB8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NpcdF8VQB8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NpcdF8VQB8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NpcdF8VQB8 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NpcdF8VQB8 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NpcdF8VQB8 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NpcdF8VQB8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NpcdF8VQB8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NpcdF8VQB8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NpcdF8VQB8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NpcdF8VQB8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NpcdF8VQB8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NpcdF8VQB8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NpcdF8VQB8 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NpcdF8VQB8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NpcdF8VQB8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NpcdF8VQB8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NpcdF8VQB8 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NpcdF8VQB8 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NpcdF8VQB8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NpcdF8VQB8 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms