Protein–RNA interactions for Protein: F6Z6Z2

3110082J24Rik, RIKEN cDNA 3110082J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3110082J24RikF6Z6Z2 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
3110082J24RikF6Z6Z2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
3110082J24RikF6Z6Z2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
3110082J24RikF6Z6Z2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
3110082J24RikF6Z6Z2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
3110082J24RikF6Z6Z2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
3110082J24RikF6Z6Z2 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
3110082J24RikF6Z6Z2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
3110082J24RikF6Z6Z2 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
3110082J24RikF6Z6Z2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
3110082J24RikF6Z6Z2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
3110082J24RikF6Z6Z2 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
3110082J24RikF6Z6Z2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
3110082J24RikF6Z6Z2 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
3110082J24RikF6Z6Z2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
3110082J24RikF6Z6Z2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
3110082J24RikF6Z6Z2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
3110082J24RikF6Z6Z2 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
3110082J24RikF6Z6Z2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
3110082J24RikF6Z6Z2 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
3110082J24RikF6Z6Z2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
3110082J24RikF6Z6Z2 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
3110082J24RikF6Z6Z2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
3110082J24RikF6Z6Z2 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
3110082J24RikF6Z6Z2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
3110082J24RikF6Z6Z2 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
3110082J24RikF6Z6Z2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
3110082J24RikF6Z6Z2 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
3110082J24RikF6Z6Z2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
3110082J24RikF6Z6Z2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
3110082J24RikF6Z6Z2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
3110082J24RikF6Z6Z2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
3110082J24RikF6Z6Z2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms