Protein–RNA interactions for Protein: F6YHC1

Gm6482, Predicted gene 6482 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6482F6YHC1 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm6482F6YHC1 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm6482F6YHC1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm6482F6YHC1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm6482F6YHC1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm6482F6YHC1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm6482F6YHC1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6482F6YHC1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6482F6YHC1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6482F6YHC1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6482F6YHC1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6482F6YHC1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6482F6YHC1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6482F6YHC1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6482F6YHC1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6482F6YHC1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6482F6YHC1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6482F6YHC1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6482F6YHC1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6482F6YHC1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6482F6YHC1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6482F6YHC1 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6482F6YHC1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6482F6YHC1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm6482F6YHC1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm6482F6YHC1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms