Protein–RNA interactions for Protein: F6UCX4

Sptbn5, Spectrin beta, non-erythrocytic 5 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn5F6UCX4 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Sptbn5F6UCX4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Sptbn5F6UCX4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms