Protein–RNA interactions for Protein: F6QRE9

Erich3, Glutamate-rich 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erich3F6QRE9 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Erich3F6QRE9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Erich3F6QRE9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Erich3F6QRE9 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Erich3F6QRE9 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Erich3F6QRE9 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Erich3F6QRE9 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Erich3F6QRE9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Erich3F6QRE9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Erich3F6QRE9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Erich3F6QRE9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Erich3F6QRE9 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Erich3F6QRE9 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Erich3F6QRE9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Erich3F6QRE9 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Erich3F6QRE9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Erich3F6QRE9 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Erich3F6QRE9 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Erich3F6QRE9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Erich3F6QRE9 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Erich3F6QRE9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Erich3F6QRE9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Erich3F6QRE9 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Erich3F6QRE9 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Erich3F6QRE9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Erich3F6QRE9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Erich3F6QRE9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Erich3F6QRE9 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Erich3F6QRE9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Erich3F6QRE9 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Erich3F6QRE9 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Erich3F6QRE9 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Erich3F6QRE9 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Erich3F6QRE9 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Erich3F6QRE9 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Erich3F6QRE9 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Erich3F6QRE9 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Erich3F6QRE9 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Erich3F6QRE9 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Erich3F6QRE9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Erich3F6QRE9 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Erich3F6QRE9 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
Erich3F6QRE9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Erich3F6QRE9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Erich3F6QRE9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Erich3F6QRE9 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Erich3F6QRE9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Erich3F6QRE9 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Erich3F6QRE9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Erich3F6QRE9 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Erich3F6QRE9 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
Erich3F6QRE9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Erich3F6QRE9 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Erich3F6QRE9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Erich3F6QRE9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Erich3F6QRE9 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Erich3F6QRE9 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Erich3F6QRE9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Erich3F6QRE9 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
Erich3F6QRE9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Erich3F6QRE9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Erich3F6QRE9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Erich3F6QRE9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Erich3F6QRE9 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Erich3F6QRE9 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Erich3F6QRE9 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Erich3F6QRE9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Erich3F6QRE9 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Erich3F6QRE9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Erich3F6QRE9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Erich3F6QRE9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Erich3F6QRE9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Erich3F6QRE9 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Erich3F6QRE9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Erich3F6QRE9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Erich3F6QRE9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
Erich3F6QRE9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Erich3F6QRE9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Erich3F6QRE9 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Erich3F6QRE9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Erich3F6QRE9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Erich3F6QRE9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Erich3F6QRE9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Erich3F6QRE9 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Erich3F6QRE9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Erich3F6QRE9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Erich3F6QRE9 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Erich3F6QRE9 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Erich3F6QRE9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Erich3F6QRE9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Erich3F6QRE9 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Erich3F6QRE9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Erich3F6QRE9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Erich3F6QRE9 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Erich3F6QRE9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Erich3F6QRE9 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Erich3F6QRE9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Erich3F6QRE9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Erich3F6QRE9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Erich3F6QRE9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms