Protein–RNA interactions for Protein: E9QAF4

Phldb3, Pleckstrin homology-like domain, family B, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phldb3E9QAF4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Phldb3E9QAF4 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Phldb3E9QAF4 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms