Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccdc74aE9Q9U8 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms