Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9R3

4930451I11Rik, RIKEN cDNA 4930451I11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930451I11RikE9Q9R3 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
4930451I11RikE9Q9R3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms