Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9Q6

Cdh18, Cadherin 18, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh18E9Q9Q6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cdh18E9Q9Q6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdh18E9Q9Q6 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdh18E9Q9Q6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdh18E9Q9Q6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdh18E9Q9Q6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdh18E9Q9Q6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdh18E9Q9Q6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdh18E9Q9Q6 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdh18E9Q9Q6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdh18E9Q9Q6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdh18E9Q9Q6 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cdh18E9Q9Q6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdh18E9Q9Q6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdh18E9Q9Q6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdh18E9Q9Q6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cdh18E9Q9Q6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms