Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9F7

Ccdc146, Coiled-coil domain-containing 146, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc146E9Q9F7 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc146E9Q9F7 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc146E9Q9F7 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc146E9Q9F7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc146E9Q9F7 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc146E9Q9F7 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc146E9Q9F7 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc146E9Q9F7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc146E9Q9F7 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc146E9Q9F7 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc146E9Q9F7 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc146E9Q9F7 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc146E9Q9F7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc146E9Q9F7 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc146E9Q9F7 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc146E9Q9F7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc146E9Q9F7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc146E9Q9F7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc146E9Q9F7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc146E9Q9F7 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc146E9Q9F7 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc146E9Q9F7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc146E9Q9F7 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc146E9Q9F7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc146E9Q9F7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc146E9Q9F7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc146E9Q9F7 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc146E9Q9F7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc146E9Q9F7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc146E9Q9F7 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc146E9Q9F7 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc146E9Q9F7 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc146E9Q9F7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc146E9Q9F7 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc146E9Q9F7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ccdc146E9Q9F7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc146E9Q9F7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc146E9Q9F7 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc146E9Q9F7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc146E9Q9F7 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc146E9Q9F7 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc146E9Q9F7 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc146E9Q9F7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc146E9Q9F7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc146E9Q9F7 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc146E9Q9F7 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc146E9Q9F7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc146E9Q9F7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc146E9Q9F7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc146E9Q9F7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc146E9Q9F7 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc146E9Q9F7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc146E9Q9F7 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc146E9Q9F7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc146E9Q9F7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc146E9Q9F7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc146E9Q9F7 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc146E9Q9F7 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc146E9Q9F7 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc146E9Q9F7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc146E9Q9F7 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc146E9Q9F7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc146E9Q9F7 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc146E9Q9F7 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc146E9Q9F7 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc146E9Q9F7 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc146E9Q9F7 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc146E9Q9F7 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc146E9Q9F7 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc146E9Q9F7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc146E9Q9F7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc146E9Q9F7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc146E9Q9F7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc146E9Q9F7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc146E9Q9F7 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc146E9Q9F7 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc146E9Q9F7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc146E9Q9F7 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc146E9Q9F7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc146E9Q9F7 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc146E9Q9F7 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc146E9Q9F7 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc146E9Q9F7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc146E9Q9F7 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc146E9Q9F7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc146E9Q9F7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc146E9Q9F7 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc146E9Q9F7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc146E9Q9F7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc146E9Q9F7 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc146E9Q9F7 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc146E9Q9F7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc146E9Q9F7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc146E9Q9F7 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ccdc146E9Q9F7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc146E9Q9F7 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc146E9Q9F7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc146E9Q9F7 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc146E9Q9F7 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ccdc146E9Q9F7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms