Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P1

Col22a1, Collagen, type XXII, alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col22a1E9Q7P1 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col22a1E9Q7P1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col22a1E9Q7P1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col22a1E9Q7P1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Col22a1E9Q7P1 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col22a1E9Q7P1 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col22a1E9Q7P1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col22a1E9Q7P1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col22a1E9Q7P1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col22a1E9Q7P1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col22a1E9Q7P1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Col22a1E9Q7P1 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col22a1E9Q7P1 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Col22a1E9Q7P1 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col22a1E9Q7P1 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col22a1E9Q7P1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col22a1E9Q7P1 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col22a1E9Q7P1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col22a1E9Q7P1 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col22a1E9Q7P1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col22a1E9Q7P1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col22a1E9Q7P1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Col22a1E9Q7P1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col22a1E9Q7P1 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col22a1E9Q7P1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col22a1E9Q7P1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col22a1E9Q7P1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col22a1E9Q7P1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col22a1E9Q7P1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col22a1E9Q7P1 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col22a1E9Q7P1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col22a1E9Q7P1 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col22a1E9Q7P1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col22a1E9Q7P1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col22a1E9Q7P1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col22a1E9Q7P1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Col22a1E9Q7P1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col22a1E9Q7P1 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col22a1E9Q7P1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col22a1E9Q7P1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col22a1E9Q7P1 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Col22a1E9Q7P1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Col22a1E9Q7P1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Col22a1E9Q7P1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Col22a1E9Q7P1 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Col22a1E9Q7P1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Col22a1E9Q7P1 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Col22a1E9Q7P1 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Col22a1E9Q7P1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Col22a1E9Q7P1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Col22a1E9Q7P1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Col22a1E9Q7P1 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Col22a1E9Q7P1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Col22a1E9Q7P1 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Col22a1E9Q7P1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col22a1E9Q7P1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col22a1E9Q7P1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col22a1E9Q7P1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col22a1E9Q7P1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col22a1E9Q7P1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col22a1E9Q7P1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col22a1E9Q7P1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Col22a1E9Q7P1 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col22a1E9Q7P1 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col22a1E9Q7P1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col22a1E9Q7P1 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col22a1E9Q7P1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col22a1E9Q7P1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col22a1E9Q7P1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col22a1E9Q7P1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Col22a1E9Q7P1 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col22a1E9Q7P1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col22a1E9Q7P1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col22a1E9Q7P1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col22a1E9Q7P1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Col22a1E9Q7P1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col22a1E9Q7P1 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Col22a1E9Q7P1 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col22a1E9Q7P1 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Col22a1E9Q7P1 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col22a1E9Q7P1 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col22a1E9Q7P1 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Col22a1E9Q7P1 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Col22a1E9Q7P1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Col22a1E9Q7P1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col22a1E9Q7P1 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col22a1E9Q7P1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col22a1E9Q7P1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col22a1E9Q7P1 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col22a1E9Q7P1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col22a1E9Q7P1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Col22a1E9Q7P1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col22a1E9Q7P1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col22a1E9Q7P1 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Col22a1E9Q7P1 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col22a1E9Q7P1 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Col22a1E9Q7P1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Col22a1E9Q7P1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Col22a1E9Q7P1 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Col22a1E9Q7P1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms