Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6D8

C6, Complement component 6, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6E9Q6D8 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
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C6E9Q6D8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
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C6E9Q6D8 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
C6E9Q6D8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C6E9Q6D8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C6E9Q6D8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C6E9Q6D8 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
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C6E9Q6D8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
C6E9Q6D8 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C6E9Q6D8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C6E9Q6D8 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
C6E9Q6D8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
C6E9Q6D8 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
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C6E9Q6D8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C6E9Q6D8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C6E9Q6D8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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C6E9Q6D8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
C6E9Q6D8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C6E9Q6D8 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C6E9Q6D8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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C6E9Q6D8 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C6E9Q6D8 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C6E9Q6D8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
C6E9Q6D8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
C6E9Q6D8 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C6E9Q6D8 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C6E9Q6D8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
C6E9Q6D8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C6E9Q6D8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C6E9Q6D8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C6E9Q6D8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
C6E9Q6D8 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C6E9Q6D8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C6E9Q6D8 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C6E9Q6D8 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C6E9Q6D8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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C6E9Q6D8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
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C6E9Q6D8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
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C6E9Q6D8 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C6E9Q6D8 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
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C6E9Q6D8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C6E9Q6D8 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
C6E9Q6D8 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C6E9Q6D8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C6E9Q6D8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C6E9Q6D8 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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C6E9Q6D8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C6E9Q6D8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C6E9Q6D8 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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C6E9Q6D8 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C6E9Q6D8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
C6E9Q6D8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C6E9Q6D8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C6E9Q6D8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C6E9Q6D8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C6E9Q6D8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C6E9Q6D8 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
C6E9Q6D8 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C6E9Q6D8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C6E9Q6D8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C6E9Q6D8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C6E9Q6D8 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C6E9Q6D8 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C6E9Q6D8 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C6E9Q6D8 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C6E9Q6D8 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C6E9Q6D8 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C6E9Q6D8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C6E9Q6D8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
C6E9Q6D8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
C6E9Q6D8 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C6E9Q6D8 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C6E9Q6D8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C6E9Q6D8 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C6E9Q6D8 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C6E9Q6D8 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
C6E9Q6D8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
C6E9Q6D8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
C6E9Q6D8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms