Protein–RNA interactions for Protein: E9Q557

Dsp, Desmoplakin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,883 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DspE9Q557 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DspE9Q557 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DspE9Q557 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DspE9Q557 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
DspE9Q557 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
DspE9Q557 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DspE9Q557 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DspE9Q557 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DspE9Q557 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DspE9Q557 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DspE9Q557 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DspE9Q557 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DspE9Q557 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DspE9Q557 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DspE9Q557 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DspE9Q557 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DspE9Q557 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
DspE9Q557 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
DspE9Q557 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DspE9Q557 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DspE9Q557 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DspE9Q557 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
DspE9Q557 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DspE9Q557 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
DspE9Q557 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
DspE9Q557 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
DspE9Q557 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
DspE9Q557 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DspE9Q557 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DspE9Q557 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DspE9Q557 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DspE9Q557 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DspE9Q557 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DspE9Q557 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms