Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2T4

4930523C07Rik, RIKEN cDNA 4930523C07 gene, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930523C07RikE9Q2T4 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4930523C07RikE9Q2T4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
4930523C07RikE9Q2T4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4930523C07RikE9Q2T4 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4930523C07RikE9Q2T4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
4930523C07RikE9Q2T4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4930523C07RikE9Q2T4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4930523C07RikE9Q2T4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4930523C07RikE9Q2T4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
4930523C07RikE9Q2T4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4930523C07RikE9Q2T4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4930523C07RikE9Q2T4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4930523C07RikE9Q2T4 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
4930523C07RikE9Q2T4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
4930523C07RikE9Q2T4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
4930523C07RikE9Q2T4 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
4930523C07RikE9Q2T4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
4930523C07RikE9Q2T4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4930523C07RikE9Q2T4 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
4930523C07RikE9Q2T4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
4930523C07RikE9Q2T4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
4930523C07RikE9Q2T4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
4930523C07RikE9Q2T4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4930523C07RikE9Q2T4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4930523C07RikE9Q2T4 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4930523C07RikE9Q2T4 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
4930523C07RikE9Q2T4 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4930523C07RikE9Q2T4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4930523C07RikE9Q2T4 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4930523C07RikE9Q2T4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4930523C07RikE9Q2T4 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
4930523C07RikE9Q2T4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4930523C07RikE9Q2T4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
4930523C07RikE9Q2T4 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
4930523C07RikE9Q2T4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4930523C07RikE9Q2T4 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4930523C07RikE9Q2T4 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
4930523C07RikE9Q2T4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4930523C07RikE9Q2T4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
4930523C07RikE9Q2T4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4930523C07RikE9Q2T4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4930523C07RikE9Q2T4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
4930523C07RikE9Q2T4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
4930523C07RikE9Q2T4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4930523C07RikE9Q2T4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4930523C07RikE9Q2T4 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
4930523C07RikE9Q2T4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4930523C07RikE9Q2T4 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4930523C07RikE9Q2T4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4930523C07RikE9Q2T4 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4930523C07RikE9Q2T4 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4930523C07RikE9Q2T4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4930523C07RikE9Q2T4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4930523C07RikE9Q2T4 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4930523C07RikE9Q2T4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4930523C07RikE9Q2T4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4930523C07RikE9Q2T4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4930523C07RikE9Q2T4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4930523C07RikE9Q2T4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
4930523C07RikE9Q2T4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
4930523C07RikE9Q2T4 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4930523C07RikE9Q2T4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4930523C07RikE9Q2T4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4930523C07RikE9Q2T4 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4930523C07RikE9Q2T4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4930523C07RikE9Q2T4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4930523C07RikE9Q2T4 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
4930523C07RikE9Q2T4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4930523C07RikE9Q2T4 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
4930523C07RikE9Q2T4 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
4930523C07RikE9Q2T4 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4930523C07RikE9Q2T4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
4930523C07RikE9Q2T4 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
4930523C07RikE9Q2T4 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4930523C07RikE9Q2T4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4930523C07RikE9Q2T4 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
4930523C07RikE9Q2T4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
4930523C07RikE9Q2T4 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4930523C07RikE9Q2T4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
4930523C07RikE9Q2T4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4930523C07RikE9Q2T4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4930523C07RikE9Q2T4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
4930523C07RikE9Q2T4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4930523C07RikE9Q2T4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4930523C07RikE9Q2T4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
4930523C07RikE9Q2T4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
4930523C07RikE9Q2T4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
4930523C07RikE9Q2T4 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4930523C07RikE9Q2T4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4930523C07RikE9Q2T4 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4930523C07RikE9Q2T4 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4930523C07RikE9Q2T4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4930523C07RikE9Q2T4 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4930523C07RikE9Q2T4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4930523C07RikE9Q2T4 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
4930523C07RikE9Q2T4 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4930523C07RikE9Q2T4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
4930523C07RikE9Q2T4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
4930523C07RikE9Q2T4 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
4930523C07RikE9Q2T4 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms