Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrp3E9Q1T6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrp3E9Q1T6 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrp3E9Q1T6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrp3E9Q1T6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrp3E9Q1T6 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Lrp3E9Q1T6 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Lrp3E9Q1T6 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Lrp3E9Q1T6 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Lrp3E9Q1T6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Lrp3E9Q1T6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Lrp3E9Q1T6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Lrp3E9Q1T6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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