Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Myo5cE9Q1F5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Myo5cE9Q1F5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Myo5cE9Q1F5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Myo5cE9Q1F5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Myo5cE9Q1F5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Myo5cE9Q1F5 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Myo5cE9Q1F5 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Myo5cE9Q1F5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Myo5cE9Q1F5 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Myo5cE9Q1F5 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Myo5cE9Q1F5 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Myo5cE9Q1F5 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Myo5cE9Q1F5 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Myo5cE9Q1F5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Myo5cE9Q1F5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Myo5cE9Q1F5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Myo5cE9Q1F5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Myo5cE9Q1F5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Myo5cE9Q1F5 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Myo5cE9Q1F5 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Myo5cE9Q1F5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Myo5cE9Q1F5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Myo5cE9Q1F5 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Myo5cE9Q1F5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Myo5cE9Q1F5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Myo5cE9Q1F5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Myo5cE9Q1F5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Myo5cE9Q1F5 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Myo5cE9Q1F5 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Myo5cE9Q1F5 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Myo5cE9Q1F5 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Myo5cE9Q1F5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Myo5cE9Q1F5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Myo5cE9Q1F5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Myo5cE9Q1F5 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Myo5cE9Q1F5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Myo5cE9Q1F5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Myo5cE9Q1F5 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Myo5cE9Q1F5 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Myo5cE9Q1F5 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Myo5cE9Q1F5 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Myo5cE9Q1F5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Myo5cE9Q1F5 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Myo5cE9Q1F5 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Myo5cE9Q1F5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Myo5cE9Q1F5 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Myo5cE9Q1F5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Myo5cE9Q1F5 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Myo5cE9Q1F5 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Myo5cE9Q1F5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Myo5cE9Q1F5 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Myo5cE9Q1F5 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Myo5cE9Q1F5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Myo5cE9Q1F5 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Myo5cE9Q1F5 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Myo5cE9Q1F5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Myo5cE9Q1F5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Myo5cE9Q1F5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Myo5cE9Q1F5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Myo5cE9Q1F5 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Myo5cE9Q1F5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Myo5cE9Q1F5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Myo5cE9Q1F5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Myo5cE9Q1F5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Myo5cE9Q1F5 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Myo5cE9Q1F5 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Myo5cE9Q1F5 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Myo5cE9Q1F5 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Myo5cE9Q1F5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Myo5cE9Q1F5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Myo5cE9Q1F5 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Myo5cE9Q1F5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Myo5cE9Q1F5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Myo5cE9Q1F5 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Myo5cE9Q1F5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Myo5cE9Q1F5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Myo5cE9Q1F5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Myo5cE9Q1F5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Myo5cE9Q1F5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Myo5cE9Q1F5 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Myo5cE9Q1F5 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Myo5cE9Q1F5 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Myo5cE9Q1F5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Myo5cE9Q1F5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Myo5cE9Q1F5 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Myo5cE9Q1F5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Myo5cE9Q1F5 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Myo5cE9Q1F5 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Myo5cE9Q1F5 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Myo5cE9Q1F5 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Myo5cE9Q1F5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Myo5cE9Q1F5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Myo5cE9Q1F5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Myo5cE9Q1F5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Myo5cE9Q1F5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Myo5cE9Q1F5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Myo5cE9Q1F5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Myo5cE9Q1F5 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Myo5cE9Q1F5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms