Protein–RNA interactions for Protein: E9PWJ7

Abca16, ATP-binding cassette, sub-family A (ABC1), member 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abca16E9PWJ7 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Abca16E9PWJ7 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Abca16E9PWJ7 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Abca16E9PWJ7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Abca16E9PWJ7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Abca16E9PWJ7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Abca16E9PWJ7 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Abca16E9PWJ7 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Abca16E9PWJ7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Abca16E9PWJ7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Abca16E9PWJ7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Abca16E9PWJ7 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Abca16E9PWJ7 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Abca16E9PWJ7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Abca16E9PWJ7 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Abca16E9PWJ7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Abca16E9PWJ7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Abca16E9PWJ7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Abca16E9PWJ7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Abca16E9PWJ7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Abca16E9PWJ7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Abca16E9PWJ7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Abca16E9PWJ7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Abca16E9PWJ7 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Abca16E9PWJ7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Abca16E9PWJ7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Abca16E9PWJ7 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Abca16E9PWJ7 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Abca16E9PWJ7 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Abca16E9PWJ7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Abca16E9PWJ7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Abca16E9PWJ7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Abca16E9PWJ7 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Abca16E9PWJ7 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Abca16E9PWJ7 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Abca16E9PWJ7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Abca16E9PWJ7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Abca16E9PWJ7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Abca16E9PWJ7 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Abca16E9PWJ7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Abca16E9PWJ7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Abca16E9PWJ7 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Abca16E9PWJ7 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Abca16E9PWJ7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Abca16E9PWJ7 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Abca16E9PWJ7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
Abca16E9PWJ7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC28.58■■■□□ 2.16
Abca16E9PWJ7 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
Abca16E9PWJ7 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Abca16E9PWJ7 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Abca16E9PWJ7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Abca16E9PWJ7 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Abca16E9PWJ7 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Abca16E9PWJ7 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Abca16E9PWJ7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Abca16E9PWJ7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Abca16E9PWJ7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Abca16E9PWJ7 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Abca16E9PWJ7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Abca16E9PWJ7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Abca16E9PWJ7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Abca16E9PWJ7 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Abca16E9PWJ7 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Abca16E9PWJ7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Abca16E9PWJ7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Abca16E9PWJ7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Abca16E9PWJ7 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Abca16E9PWJ7 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Abca16E9PWJ7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Abca16E9PWJ7 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Abca16E9PWJ7 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Abca16E9PWJ7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Abca16E9PWJ7 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Abca16E9PWJ7 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Abca16E9PWJ7 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Abca16E9PWJ7 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Abca16E9PWJ7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Abca16E9PWJ7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Abca16E9PWJ7 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Abca16E9PWJ7 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Abca16E9PWJ7 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Abca16E9PWJ7 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Abca16E9PWJ7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Abca16E9PWJ7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Abca16E9PWJ7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Abca16E9PWJ7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Abca16E9PWJ7 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Abca16E9PWJ7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Abca16E9PWJ7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Abca16E9PWJ7 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Abca16E9PWJ7 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
Abca16E9PWJ7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
Abca16E9PWJ7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Abca16E9PWJ7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Abca16E9PWJ7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Abca16E9PWJ7 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Abca16E9PWJ7 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Abca16E9PWJ7 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Abca16E9PWJ7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Abca16E9PWJ7 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms