Protein–RNA interactions for Protein: E9PW74

Gimd1, GTPase IMAP family member GIMD1, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gimd1E9PW74 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gimd1E9PW74 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gimd1E9PW74 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gimd1E9PW74 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gimd1E9PW74 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gimd1E9PW74 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gimd1E9PW74 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Gimd1E9PW74 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gimd1E9PW74 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Gimd1E9PW74 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Gimd1E9PW74 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Gimd1E9PW74 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Gimd1E9PW74 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gimd1E9PW74 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms