Protein–RNA interactions for Protein: E9PVB3

Ccdc175, Coiled-coil domain-containing protein 175, mousemouse

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc175E9PVB3 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ccdc175E9PVB3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ccdc175E9PVB3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms