Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gcn1E9PVA8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Gnb4-208ENSMUST00000193050 423 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gcn1E9PVA8 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms