Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms