Protein–RNA interactions for Protein: D3YYP3

Gm6685, Predicted pseudogene 6685, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6685D3YYP3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm6685D3YYP3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm6685D3YYP3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm6685D3YYP3 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm6685D3YYP3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm6685D3YYP3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm6685D3YYP3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm6685D3YYP3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm6685D3YYP3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm6685D3YYP3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm6685D3YYP3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm6685D3YYP3 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm6685D3YYP3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm6685D3YYP3 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm6685D3YYP3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm6685D3YYP3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm6685D3YYP3 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm6685D3YYP3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm6685D3YYP3 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm6685D3YYP3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm6685D3YYP3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm6685D3YYP3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm6685D3YYP3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm6685D3YYP3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm6685D3YYP3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm6685D3YYP3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm6685D3YYP3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm6685D3YYP3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm6685D3YYP3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm6685D3YYP3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm6685D3YYP3 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm6685D3YYP3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm6685D3YYP3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm6685D3YYP3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm6685D3YYP3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm6685D3YYP3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm6685D3YYP3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm6685D3YYP3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm6685D3YYP3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm6685D3YYP3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm6685D3YYP3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm6685D3YYP3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm6685D3YYP3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm6685D3YYP3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm6685D3YYP3 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm6685D3YYP3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm6685D3YYP3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm6685D3YYP3 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm6685D3YYP3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm6685D3YYP3 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm6685D3YYP3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm6685D3YYP3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm6685D3YYP3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm6685D3YYP3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm6685D3YYP3 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm6685D3YYP3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm6685D3YYP3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm6685D3YYP3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm6685D3YYP3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm6685D3YYP3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm6685D3YYP3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm6685D3YYP3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm6685D3YYP3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm6685D3YYP3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm6685D3YYP3 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm6685D3YYP3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm6685D3YYP3 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm6685D3YYP3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm6685D3YYP3 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm6685D3YYP3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm6685D3YYP3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm6685D3YYP3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm6685D3YYP3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm6685D3YYP3 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm6685D3YYP3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm6685D3YYP3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm6685D3YYP3 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm6685D3YYP3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm6685D3YYP3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm6685D3YYP3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm6685D3YYP3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm6685D3YYP3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm6685D3YYP3 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm6685D3YYP3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm6685D3YYP3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm6685D3YYP3 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm6685D3YYP3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm6685D3YYP3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm6685D3YYP3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm6685D3YYP3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm6685D3YYP3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm6685D3YYP3 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm6685D3YYP3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm6685D3YYP3 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm6685D3YYP3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm6685D3YYP3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm6685D3YYP3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm6685D3YYP3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm6685D3YYP3 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm6685D3YYP3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms