Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SafbD3YXK2 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SafbD3YXK2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SafbD3YXK2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SafbD3YXK2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SafbD3YXK2 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SafbD3YXK2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SafbD3YXK2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SafbD3YXK2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SafbD3YXK2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SafbD3YXK2 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SafbD3YXK2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SafbD3YXK2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SafbD3YXK2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SafbD3YXK2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SafbD3YXK2 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SafbD3YXK2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SafbD3YXK2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SafbD3YXK2 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SafbD3YXK2 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SafbD3YXK2 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SafbD3YXK2 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SafbD3YXK2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SafbD3YXK2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SafbD3YXK2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SafbD3YXK2 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SafbD3YXK2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SafbD3YXK2 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SafbD3YXK2 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SafbD3YXK2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SafbD3YXK2 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SafbD3YXK2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SafbD3YXK2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SafbD3YXK2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SafbD3YXK2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SafbD3YXK2 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SafbD3YXK2 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SafbD3YXK2 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SafbD3YXK2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SafbD3YXK2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SafbD3YXK2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SafbD3YXK2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SafbD3YXK2 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SafbD3YXK2 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SafbD3YXK2 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SafbD3YXK2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SafbD3YXK2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SafbD3YXK2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SafbD3YXK2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SafbD3YXK2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SafbD3YXK2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SafbD3YXK2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SafbD3YXK2 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SafbD3YXK2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SafbD3YXK2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SafbD3YXK2 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SafbD3YXK2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SafbD3YXK2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SafbD3YXK2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SafbD3YXK2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SafbD3YXK2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SafbD3YXK2 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SafbD3YXK2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SafbD3YXK2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SafbD3YXK2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SafbD3YXK2 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SafbD3YXK2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SafbD3YXK2 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SafbD3YXK2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SafbD3YXK2 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SafbD3YXK2 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SafbD3YXK2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SafbD3YXK2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SafbD3YXK2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
SafbD3YXK2 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SafbD3YXK2 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SafbD3YXK2 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SafbD3YXK2 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SafbD3YXK2 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SafbD3YXK2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SafbD3YXK2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SafbD3YXK2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SafbD3YXK2 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SafbD3YXK2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SafbD3YXK2 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SafbD3YXK2 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SafbD3YXK2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SafbD3YXK2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SafbD3YXK2 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SafbD3YXK2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SafbD3YXK2 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SafbD3YXK2 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SafbD3YXK2 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SafbD3YXK2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SafbD3YXK2 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SafbD3YXK2 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SafbD3YXK2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SafbD3YXK2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SafbD3YXK2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SafbD3YXK2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms