Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Samd1D3YXK1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Samd1D3YXK1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Samd1D3YXK1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Samd1D3YXK1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Samd1D3YXK1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Samd1D3YXK1 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Samd1D3YXK1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Samd1D3YXK1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Samd1D3YXK1 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Samd1D3YXK1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Samd1D3YXK1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Samd1D3YXK1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Samd1D3YXK1 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Samd1D3YXK1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Samd1D3YXK1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Samd1D3YXK1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Samd1D3YXK1 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Samd1D3YXK1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Samd1D3YXK1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Samd1D3YXK1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Samd1D3YXK1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Samd1D3YXK1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Samd1D3YXK1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Samd1D3YXK1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Samd1D3YXK1 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Samd1D3YXK1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Samd1D3YXK1 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Samd1D3YXK1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.6 ms