Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm17333C6EQI3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Gm17333C6EQI3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm17333C6EQI3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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