Protein–RNA interactions for Protein: B9EKK6

Nxpe3, Family with sequence similarity 55, member C, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxpe3B9EKK6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nxpe3B9EKK6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nxpe3B9EKK6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nxpe3B9EKK6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nxpe3B9EKK6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nxpe3B9EKK6 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nxpe3B9EKK6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nxpe3B9EKK6 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nxpe3B9EKK6 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nxpe3B9EKK6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nxpe3B9EKK6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Nxpe3B9EKK6 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms