Protein–RNA interactions for Protein: B9EKI3

Tmf1, TATA element modulatory factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmf1B9EKI3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmf1B9EKI3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmf1B9EKI3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmf1B9EKI3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmf1B9EKI3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmf1B9EKI3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmf1B9EKI3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmf1B9EKI3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmf1B9EKI3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmf1B9EKI3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmf1B9EKI3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmf1B9EKI3 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmf1B9EKI3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmf1B9EKI3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tmf1B9EKI3 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmf1B9EKI3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmf1B9EKI3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmf1B9EKI3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmf1B9EKI3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmf1B9EKI3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmf1B9EKI3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmf1B9EKI3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmf1B9EKI3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tmf1B9EKI3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmf1B9EKI3 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmf1B9EKI3 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmf1B9EKI3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmf1B9EKI3 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmf1B9EKI3 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmf1B9EKI3 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmf1B9EKI3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmf1B9EKI3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tmf1B9EKI3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmf1B9EKI3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmf1B9EKI3 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmf1B9EKI3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmf1B9EKI3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmf1B9EKI3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmf1B9EKI3 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tmf1B9EKI3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Tmf1B9EKI3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tmf1B9EKI3 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tmf1B9EKI3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tmf1B9EKI3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tmf1B9EKI3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tmf1B9EKI3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tmf1B9EKI3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tmf1B9EKI3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tmf1B9EKI3 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tmf1B9EKI3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tmf1B9EKI3 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tmf1B9EKI3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tmf1B9EKI3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tmf1B9EKI3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmf1B9EKI3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmf1B9EKI3 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmf1B9EKI3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmf1B9EKI3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmf1B9EKI3 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmf1B9EKI3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmf1B9EKI3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tmf1B9EKI3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmf1B9EKI3 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmf1B9EKI3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmf1B9EKI3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmf1B9EKI3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmf1B9EKI3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmf1B9EKI3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmf1B9EKI3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmf1B9EKI3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tmf1B9EKI3 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmf1B9EKI3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmf1B9EKI3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmf1B9EKI3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmf1B9EKI3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmf1B9EKI3 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmf1B9EKI3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmf1B9EKI3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmf1B9EKI3 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tmf1B9EKI3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmf1B9EKI3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmf1B9EKI3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmf1B9EKI3 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmf1B9EKI3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmf1B9EKI3 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmf1B9EKI3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmf1B9EKI3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmf1B9EKI3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmf1B9EKI3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmf1B9EKI3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmf1B9EKI3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmf1B9EKI3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmf1B9EKI3 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmf1B9EKI3 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tmf1B9EKI3 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmf1B9EKI3 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmf1B9EKI3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmf1B9EKI3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmf1B9EKI3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tmf1B9EKI3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms