Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

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Length 276 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.89■□□□□ 0.46
Phf11bB4XVQ1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Phf11bB4XVQ1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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