Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Phf11cB4XVP9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Phf11cB4XVP9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms