Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC1

Trappc11, Trafficking protein particle complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc11B2RXC1 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Trappc11B2RXC1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc11B2RXC1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc11B2RXC1 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc11B2RXC1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc11B2RXC1 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc11B2RXC1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc11B2RXC1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc11B2RXC1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc11B2RXC1 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc11B2RXC1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc11B2RXC1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc11B2RXC1 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc11B2RXC1 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc11B2RXC1 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc11B2RXC1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Trappc11B2RXC1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc11B2RXC1 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc11B2RXC1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc11B2RXC1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc11B2RXC1 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc11B2RXC1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc11B2RXC1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc11B2RXC1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc11B2RXC1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc11B2RXC1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc11B2RXC1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc11B2RXC1 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Trappc11B2RXC1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc11B2RXC1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc11B2RXC1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc11B2RXC1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc11B2RXC1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc11B2RXC1 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc11B2RXC1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Trappc11B2RXC1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc11B2RXC1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc11B2RXC1 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc11B2RXC1 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc11B2RXC1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc11B2RXC1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc11B2RXC1 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc11B2RXC1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc11B2RXC1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc11B2RXC1 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc11B2RXC1 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc11B2RXC1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc11B2RXC1 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Trappc11B2RXC1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc11B2RXC1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc11B2RXC1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc11B2RXC1 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc11B2RXC1 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc11B2RXC1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc11B2RXC1 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trappc11B2RXC1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc11B2RXC1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc11B2RXC1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc11B2RXC1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc11B2RXC1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc11B2RXC1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc11B2RXC1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc11B2RXC1 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc11B2RXC1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc11B2RXC1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc11B2RXC1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc11B2RXC1 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc11B2RXC1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc11B2RXC1 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc11B2RXC1 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc11B2RXC1 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc11B2RXC1 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc11B2RXC1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc11B2RXC1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trappc11B2RXC1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trappc11B2RXC1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms