Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Usf3B2RUQ2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms